Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SobpQ0P5V2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SobpQ0P5V2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SobpQ0P5V2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SobpQ0P5V2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms