Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubxn2bQ0KL01 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubxn2bQ0KL01 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms