Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc4Q08624 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc4Q08624 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms