Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gata4Q08369 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms