Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ebf1Q07802 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf1Q07802 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ebf1Q07802 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms