Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdf3Q07104 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdf3Q07104 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms