Protein–RNA interactions for Protein: Q05920

Pc, Pyruvate carboxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcQ05920 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PcQ05920 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcQ05920 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcQ05920 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcQ05920 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcQ05920 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcQ05920 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcQ05920 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcQ05920 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PcQ05920 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PcQ05920 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcQ05920 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PcQ05920 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PcQ05920 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PcQ05920 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PcQ05920 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PcQ05920 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PcQ05920 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PcQ05920 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PcQ05920 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PcQ05920 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PcQ05920 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcQ05920 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcQ05920 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcQ05920 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcQ05920 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcQ05920 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcQ05920 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcQ05920 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcQ05920 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcQ05920 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcQ05920 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcQ05920 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcQ05920 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcQ05920 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcQ05920 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcQ05920 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcQ05920 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcQ05920 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcQ05920 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcQ05920 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcQ05920 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcQ05920 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PcQ05920 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PcQ05920 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PcQ05920 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcQ05920 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcQ05920 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcQ05920 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcQ05920 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcQ05920 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcQ05920 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcQ05920 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcQ05920 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcQ05920 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcQ05920 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcQ05920 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcQ05920 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PcQ05920 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PcQ05920 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PcQ05920 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PcQ05920 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PcQ05920 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms