Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Runx1Q03347 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Runx1Q03347 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Runx1Q03347 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Runx1Q03347 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms