Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp39Q02525 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp39Q02525 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp39Q02525 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms