Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EgfrQ01279 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EgfrQ01279 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EgfrQ01279 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EgfrQ01279 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms