Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col1a2Q01149 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col1a2Q01149 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col1a2Q01149 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms