Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2cQ01098 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grin2cQ01098 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2cQ01098 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms