Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2bQ01097 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2bQ01097 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2bQ01097 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Grin2bQ01097 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Grin2bQ01097 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Grin2bQ01097 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Grin2bQ01097 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Grin2bQ01097 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Grin2bQ01097 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Grin2bQ01097 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 418.3 ms