Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrcdQ00LT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrcdQ00LT2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrcdQ00LT2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms