Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col8a1Q00780 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col8a1Q00780 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col8a1Q00780 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms