Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp10Q000W5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp10Q000W5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms