Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Loxl1P97873 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Loxl1P97873 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Loxl1P97873 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms