Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pitx2P97474 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pitx2P97474 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pitx2P97474 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pitx2P97474 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms