Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad4P97471 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad4P97471 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad4P97471 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad4P97471 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad4P97471 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad4P97471 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad4P97471 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad4P97471 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad4P97471 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad4P97471 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smad4P97471 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad4P97471 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad4P97471 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms