Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Npas1P97459 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas1P97459 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas1P97459 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas1P97459 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas1P97459 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas1P97459 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Npas1P97459 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Npas1P97459 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Npas1P97459 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas1P97459 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Npas1P97459 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms