Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b3P97370 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b3P97370 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b3P97370 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b3P97370 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp1b3P97370 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp1b3P97370 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms