Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhodP97348 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhodP97348 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RhodP97348 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhodP97348 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhodP97348 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhodP97348 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RhodP97348 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RhodP97348 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhodP97348 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhodP97348 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhodP97348 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RhodP97348 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhodP97348 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RhodP97348 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhodP97348 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhodP97348 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RhodP97348 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhodP97348 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhodP97348 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhodP97348 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhodP97348 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhodP97348 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RhodP97348 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RhodP97348 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RhodP97348 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RhodP97348 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhodP97348 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhodP97348 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RhodP97348 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RhodP97348 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhodP97348 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhodP97348 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RhodP97348 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RhodP97348 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhodP97348 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RhodP97348 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RhodP97348 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RhodP97348 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms