Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh6P97326 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh6P97326 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh6P97326 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh6P97326 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh6P97326 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms