Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkdcP97313 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkdcP97313 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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