Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vgll3P85442 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vgll3P85442 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vgll3P85442 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms