Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arf1P84078 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arf1P84078 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arf1P84078 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arf1P84078 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arf1P84078 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arf1P84078 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arf1P84078 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arf1P84078 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arf1P84078 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms