Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx2P81066 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx2P81066 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx2P81066 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx2P81066 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx2P81066 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx2P81066 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx2P81066 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx2P81066 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms