Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctps1P70698 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctps1P70698 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctps1P70698 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms