Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sparcl1P70663 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sparcl1P70663 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sparcl1P70663 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms