Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ldb1P70662 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb1P70662 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb1P70662 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms