Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad50P70388 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rad50P70388 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad50P70388 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rad50P70388 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rad50P70388 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rad50P70388 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad50P70388 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rad50P70388 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms