Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad1P70340 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad1P70340 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad1P70340 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad1P70340 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad1P70340 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad1P70340 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad1P70340 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms