Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NficP70255 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NficP70255 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NficP70255 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NficP70255 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NficP70255 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NficP70255 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NficP70255 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NficP70255 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NficP70255 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NficP70255 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NficP70255 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NficP70255 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NficP70255 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NficP70255 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NficP70255 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NficP70255 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NficP70255 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NficP70255 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NficP70255 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NficP70255 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NficP70255 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NficP70255 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NficP70255 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NficP70255 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NficP70255 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NficP70255 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NficP70255 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NficP70255 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NficP70255 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NficP70255 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NficP70255 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NficP70255 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NficP70255 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NficP70255 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NficP70255 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NficP70255 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NficP70255 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NficP70255 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NficP70255 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NficP70255 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NficP70255 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NficP70255 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NficP70255 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NficP70255 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NficP70255 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NficP70255 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NficP70255 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NficP70255 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NficP70255 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NficP70255 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms