Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd13P70217 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxd13P70217 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms