Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf5P70191 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf5P70191 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Traf5P70191 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf5P70191 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf5P70191 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Traf5P70191 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf5P70191 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf5P70191 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf5P70191 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf5P70191 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf5P70191 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Traf5P70191 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms