Protein–RNA interactions for Protein: P63042

Stmn4, Stathmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn4P63042 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn4P63042 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn4P63042 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn4P63042 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stmn4P63042 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stmn4P63042 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmn4P63042 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms