Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl39P62892 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl39P62892 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl39P62892 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms