Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl23P62830 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl23P62830 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl23P62830 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl23P62830 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl23P62830 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl23P62830 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms