Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf6P62331 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf6P62331 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arf6P62331 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arf6P62331 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arf6P62331 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf6P62331 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms