Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc1P62192 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmc1P62192 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmc1P62192 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms