Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr1aP61164 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actr1aP61164 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actr1aP61164 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Actr1aP61164 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actr1aP61164 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actr1aP61164 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actr1aP61164 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Actr1aP61164 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Actr1aP61164 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr1aP61164 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Actr1aP61164 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Actr1aP61164 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Actr1aP61164 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Actr1aP61164 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Actr1aP61164 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actr1aP61164 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms