Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcbp1P60335 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcbp1P60335 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcbp1P60335 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcbp1P60335 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms