Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3bP59470 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr3bP59470 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr3bP59470 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr3bP59470 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr3bP59470 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms