Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fermt1P59113 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fermt1P59113 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fermt1P59113 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms