Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uchl4P58321 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uchl4P58321 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl4P58321 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms