Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpdl3bP58242 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpdl3bP58242 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpdl3bP58242 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms