Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gsc2P56916 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gsc2P56916 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gsc2P56916 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms