Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox17P56394 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox17P56394 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox17P56394 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox17P56394 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cox17P56394 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms