Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtskP55097 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtskP55097 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtskP55097 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtskP55097 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtskP55097 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtskP55097 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtskP55097 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtskP55097 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CtskP55097 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CtskP55097 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtskP55097 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtskP55097 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtskP55097 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtskP55097 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtskP55097 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtskP55097 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtskP55097 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtskP55097 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtskP55097 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtskP55097 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtskP55097 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtskP55097 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtskP55097 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtskP55097 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtskP55097 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtskP55097 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CtskP55097 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtskP55097 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtskP55097 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CtskP55097 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtskP55097 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtskP55097 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CtskP55097 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtskP55097 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtskP55097 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CtskP55097 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CtskP55097 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CtskP55097 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtskP55097 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CtskP55097 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtskP55097 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtskP55097 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtskP55097 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtskP55097 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CtskP55097 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CtskP55097 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtskP55097 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CtskP55097 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtskP55097 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtskP55097 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtskP55097 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtskP55097 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms