Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NrlP54846 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrlP54846 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrlP54846 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrlP54846 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrlP54846 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NrlP54846 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrlP54846 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NrlP54846 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NrlP54846 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NrlP54846 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NrlP54846 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NrlP54846 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NrlP54846 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NrlP54846 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NrlP54846 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NrlP54846 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NrlP54846 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NrlP54846 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NrlP54846 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NrlP54846 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NrlP54846 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NrlP54846 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NrlP54846 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NrlP54846 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NrlP54846 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NrlP54846 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NrlP54846 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NrlP54846 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NrlP54846 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrlP54846 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NrlP54846 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrlP54846 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NrlP54846 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NrlP54846 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrlP54846 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrlP54846 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrlP54846 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NrlP54846 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NrlP54846 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrlP54846 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrlP54846 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrlP54846 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NrlP54846 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrlP54846 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrlP54846 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrlP54846 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NrlP54846 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrlP54846 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrlP54846 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrlP54846 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrlP54846 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NrlP54846 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrlP54846 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrlP54846 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrlP54846 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrlP54846 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrlP54846 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NrlP54846 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrlP54846 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrlP54846 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrlP54846 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrlP54846 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrlP54846 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NrlP54846 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NrlP54846 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NrlP54846 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NrlP54846 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms